MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187081	GCA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187081	CTG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187081	T	7	7	1916	1922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187081	CCAG	2	8	1938	1945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NT_187081	GGA	2	6	1993	1998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187081	TATT	2	8	1999	2006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187081	ATAA	2	8	2047	2054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187081	AT	3	6	2055	2060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187081	AAT	2	6	2066	2071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187081	TAA	2	6	2096	2101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187081	GCGCT	2	10	3987	3996	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NT_187081	ATA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187081	GGC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187081	GTG	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187081	AAC	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187081	TATGG	2	10	9314	9323	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187081	TAA	2	6	9364	9369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187081	AC	3	6	9386	9391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NT_187081	ATC	2	6	9431	9436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187081	A	7	7	9467	9473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187081	ACGG	2	8	9499	9506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187081	CAT	2	6	10453	10458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187081	ATT	2	6	10475	10480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187081	TTA	3	9	10530	10538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187081	TAA	2	6	10543	10548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187081	GC	3	6	10570	10575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NT_187081	ATA	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187081	T	6	6	12084	12089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187081	ATGA	2	8	12096	12103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187081	TG	3	6	13010	13015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187081	TG	3	6	17880	17885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187081	GGC	2	6	17892	17897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187081	GGC	2	6	17921	17926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187081	CCA	2	6	17953	17958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NT_187081	GC	3	6	17963	17968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NT_187081	CCG	2	6	17981	17986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NT_187081	AAT	2	6	18939	18944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187081	GAT	3	9	19096	19104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187081	AT	3	6	20247	20252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187081	CT	4	8	21697	21704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NT_187081	ATT	2	6	21733	21738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187081	GGC	2	6	21742	21747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187081	GCC	2	6	24059	24064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NT_187081	CTG	2	6	24069	24074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187081	CGG	2	6	24075	24080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187081	T	6	6	25443	25448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187081	CAA	2	6	25544	25549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187081	AGAA	2	8	25580	25587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187081	AAGG	2	8	27822	27829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187081	TACT	2	8	28639	28646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NT_187081	GCG	2	6	28687	28692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187081	ATA	2	6	28738	28743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187081	GAG	2	6	28746	28751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187081	TGC	2	6	31969	31974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187081	GGCGC	2	10	31980	31989	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NT_187081	CGC	2	6	32031	32036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NT_187081	AGC	2	6	32565	32570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187081	ACAA	2	8	33935	33942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NT_187081	CTT	2	6	37592	37597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187081	CTG	2	6	37614	37619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187081	CCT	2	6	37634	37639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NT_187081	AAT	2	6	37708	37713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187081	T	9	9	37733	37741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187081	GGC	2	6	37778	37783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187081	TA	3	6	37938	37943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187081	AAGG	2	8	37959	37966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187081	TCA	2	6	37989	37994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187081	A	6	6	38013	38018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187081	CTG	2	6	38046	38051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187081	T	6	6	38137	38142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187081	T	6	6	38152	38157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187081	AGTC	2	8	40321	40328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NT_187081	GAA	2	6	40415	40420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187081	CT	3	6	40457	40462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187081	A	8	8	40474	40481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187081	TAT	2	6	40489	40494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187081	CAT	2	6	40569	40574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187081	A	6	6	40582	40587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187081	GAC	2	6	40656	40661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187081	GA	3	6	43058	43063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187081	CGT	2	6	43107	43112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187081	AGC	2	6	44055	44060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187081	AATT	2	8	44115	44122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187081	AT	4	8	44169	44176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187081	TA	3	6	44245	44250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187081	CCA	2	6	44377	44382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NT_187081	GAA	2	6	44391	44396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187081	TAA	2	6	45424	45429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187081	CA	3	6	47165	47170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NT_187081	T	8	8	47923	47930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187081	C	7	7	47943	47949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NT_187081	TTA	2	6	47988	47993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187081	CAA	2	6	48046	48051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187081	GGAG	2	8	48626	48633	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187081	CT	3	6	49919	49924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NT_187081	T	6	6	50716	50721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187081	TGA	2	6	50733	50738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187081	GTC	3	9	54908	54916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187081	AAT	2	6	54965	54970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187081	GA	3	6	54971	54976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187081	GGC	2	6	56541	56546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187081	ACG	2	6	56567	56572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187081	AATC	2	8	61132	61139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NT_187081	GATT	2	8	61140	61147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187081	AGT	2	6	61337	61342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187081	GCC	2	6	62827	62832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NT_187081	A	6	6	62846	62851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187081	GACG	2	8	66081	66088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NT_187081	AACA	2	8	66102	66109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NT_187081	ACA	2	6	66178	66183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187081	ATT	2	6	66619	66624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187081	AATT	2	8	66625	66632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187081	GAT	2	6	66735	66740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187081	A	6	6	67084	67089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187081	CG	3	6	67096	67101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NT_187081	CGAG	2	8	67152	67159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NT_187081	GGT	2	6	67173	67178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187081	CGC	2	6	67212	67217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NT_187081	GGGA	2	8	70433	70440	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187081	AAATG	2	10	70441	70450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187081	ATG	2	6	70461	70466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187081	GTG	2	6	71896	71901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187081	A	6	6	72826	72831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187081	TTG	2	6	72985	72990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187081	TTAA	2	8	73003	73010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187081	TG	3	6	73015	73020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187081	ATT	2	6	73026	73031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187081	AAT	2	6	73035	73040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187081	CAGG	2	8	73101	73108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NT_187081	TA	3	6	73124	73129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187081	AGAT	2	8	73239	73246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187081	T	6	6	73825	73830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187081	ATTT	2	8	73871	73878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187081	TGG	2	6	73915	73920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187081	TAA	2	6	73922	73927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187081	A	6	6	74954	74959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187081	CGG	2	6	75002	75007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187081	A	8	8	75022	75029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187081	AAT	2	6	75088	75093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187081	CGC	2	6	75110	75115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NT_187081	ATT	2	6	75122	75127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187081	AT	3	6	75248	75253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187081	ACTT	2	8	75266	75273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NT_187081	GGT	2	6	75287	75292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187081	TGAAAA	2	12	75819	75830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187081	T	8	8	75850	75857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187081	CCTG	2	8	77505	77512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NT_187081	A	6	6	77522	77527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187081	AGA	2	6	77573	77578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NT_187081	CGAT	2	8	127917	127924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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290	NT_187081	GGT	2	6	128034	128039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NT_187081	TA	3	6	129479	129484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NT_187081	TAT	2	6	129493	129498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NT_187081	TGT	2	6	131326	131331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NT_187081	TGA	2	6	131403	131408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NT_187081	GCGCT	2	10	131430	131439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
296	NT_187081	GGC	2	6	131464	131469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
297	NT_187081	A	7	7	132375	132381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NT_187081	AGCGC	2	10	132444	132453	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
299	NT_187081	CGG	2	6	132472	132477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
300	NT_187081	CCTG	2	8	132492	132499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
301	NT_187081	AT	3	6	135463	135468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NT_187081	TTC	2	6	135475	135480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NT_187081	AGG	2	6	135503	135508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
304	NT_187081	TAG	2	6	135511	135516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NT_187081	AAG	2	6	135519	135524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
306	NT_187081	CTGT	2	8	135592	135599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
307	NT_187081	TAA	2	6	138419	138424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NT_187081	TTC	2	6	138438	138443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
309	NT_187081	GATGAC	2	12	142748	142759	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
310	NT_187081	AG	3	6	142775	142780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
311	NT_187081	AGCG	2	8	142795	142802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
312	NT_187081	ATG	2	6	142839	142844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
313	NT_187081	CCT	2	6	143833	143838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
314	NT_187081	GATT	2	8	145585	145592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
315	NT_187081	GGC	2	6	145605	145610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
316	NT_187081	ACC	2	6	145619	145624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
317	NT_187081	T	6	6	146548	146553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NT_187081	G	7	7	146650	146656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
319	NT_187081	TGA	2	6	146711	146716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
320	NT_187081	GGA	2	6	146726	146731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
321	NT_187081	GTTT	2	8	149433	149440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
322	NT_187081	TAAA	2	8	152610	152617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NT_187081	CCT	2	6	152646	152651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
324	NT_187081	TA	3	6	152922	152927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NT_187081	AGGCG	2	10	153008	153017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
326	NT_187081	CAGG	2	8	153026	153033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
327	NT_187081	G	6	6	153032	153037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
328	NT_187081	GTTA	2	8	153122	153129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
329	NT_187081	GATT	2	8	153146	153153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
330	NT_187081	GAC	2	6	153211	153216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
331	NT_187081	A	7	7	155997	156003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NT_187081	GCCC	2	8	156004	156011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
333	NT_187081	TG	3	6	156015	156020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
334	NT_187081	A	6	6	156054	156059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NT_187081	AGT	2	6	156081	156086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
336	NT_187081	TTC	2	6	156107	156112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
337	NT_187081	T	6	6	156198	156203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
338	NT_187081	AT	3	6	156205	156210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NT_187081	TTGG	2	8	156217	156224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
340	NT_187081	ATA	2	6	156297	156302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NT_187081	ATT	2	6	156330	156335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NT_187081	GTT	2	6	156384	156389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
343	NT_187081	CAG	2	6	156739	156744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
344	NT_187081	CAGA	2	8	156748	156755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
345	NT_187081	TAC	2	6	156772	156777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
346	NT_187081	GA	3	6	156779	156784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
347	NT_187081	TAGG	2	8	156813	156820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
348	NT_187081	TCA	2	6	156891	156896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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350	NT_187081	A	7	7	156931	156937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
351	NT_187081	CTT	2	6	156953	156958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
352	NT_187081	GCA	2	6	156962	156967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
353	NT_187081	GATT	2	8	157004	157011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.